Terdapat empat cara untuk nanopartikles memasuki tubuh manusia: penyedutan, menelan, penyerapan dari kulit, atau suntikan yang disengajakan (atau dibebaskan dari implan) semasa prosedur perubatan. Sekali dalam tubuh manusia, mereka mempunyai tahap mobiliti yang tinggi. Dalam sesetengah kes, mereka juga boleh menyeberangi halangan darah otak.
Tingkah laku nanopartikles dalam organ masih merupakan subjek yang besar untuk dikaji. Pada asasnya, tingkah laku nanopartikles bergantung kepada saiz, bentuk dan aktiviti interaksi mereka dengan tisu-tisu di sekelilingnya. Mereka boleh menyebabkan "beban" phages (sel-sel yang menelan dan memusnahkan bahan-bahan asing), yang boleh mencetuskan demam pertahanan dan mengurangkan imuniti badan. Mereka boleh berkumpul dalam organ-organ kerana mereka tidak boleh merendahkan atau merendahkan perlahan-lahan. Satu lagi kebimbangan ialah bahaya tindak balas mereka dengan beberapa proses biologi dalam tubuh manusia. Oleh kerana kawasan permukaan yang besar, nanopartikles terdedah kepada tisu dan cecair akan segera mengiklankan makromolecules yang mereka hadapi. Ini akan menjejaskan, sebagai contoh, mekanisme pelarasan enzim dan protein lain.